Los ecosistemas de alta mar son dos: el Golfo de California, con 830 km de costas; y el Océano Pacífico, con 1400 km; mismos que dan origen a playas, arrecifes, bahías, ensenadas, esteros, lagunas, puertos y cabos y a un rico potencial pesquero.
En cuanto a la costa del Océano Pacífico, ésta recibe la corriente del Kuroshivo, la cual permite que sus aguas sean cálidas en invierno y frías en verano. Sus olas son muy altas y espaciadas. La temperatura del agua es cálida con oleaje frecuente.
Los organismos representativos son algas, abulones, almeja pismo, langosta, marlin, pez vela, atún, ballena gris, camarón, jaiba, caracoles, peces abisales, tiburones, lobos marinos, delfines y aves.
Al Golfo de California se le considera el Oasis Marino del mundo por su diversidad biológica y belleza; presenta abundancia de islas y accidentes geográficos.
Algunos organismos presentes en este cuerpo de agua son: diferentes tipos de algas, corales, fitoplancton, zooplancton, tiburones, mantarrayas, peces abisales, dorado, langosta,jaiba, camarón, calamar, caracoles, pargos, ballenas, lobos; así como gran diversidad de aves marinas.