Sus límites son, al norte con Laguna San Ignacio; al sur con el Istmo de La Paz; al este con la Sierra de la Giganta y al oeste con el Océano Pacífico.
El clima va de muy seco cálido, hasta semiseco semicálido, con lluvias dominantes en verano. La precipitación va de 80 a 230 mm anuales. La topografía es plana con pendientes ligeras, siendo surcada por innumerables cauces secos.
Dentro de sus ecosistemas la Laguna de San Isidro es considerada refugio natural del águila pescadora y de aves migratorias; también bahía Magdalena, puerto San Carlos y puerto Adolfo López Mateos son refugio de aves acuáticas migratorias y sitios de reproducción de la ballena gris.
En el Valle de Santo Domingo se ubican localidades dedicadas a las actividades agrícolas, ganaderas y comerciales.
En la costa se encuentran pueblos y campos pesqueros que se dedican a la explotación ribereña de los productos marinos como Cancún, Puerto Chale, Conquista Agraria, La Poza Grande; y otros, como López Mateos, también al turismo. En la sierra comunidades ganaderas como San Isidro,La Purísima y San Luis Gonzaga.